昭和２年以来，岩波文庫より刊行された自然科学書の全書目およびその現状（1997年11月現在）。ほとんど絶版となっており，そのなかでも動物哲学は古書価が高いことで知られている。
| 書名 | 著者名 | 発行年 | |
| 古い医術について | ヒポクラテス | 1963 | |
| 天体の回転について | コペルニクス | 1953 | |
| 星界の報告 | ガリレオ・ガリレイ | 1976 | 絶版 |
| 天文対話 全２冊 | ガリレオ・ガリレイ | 1959/1961 | |
| 新科学対話 全２冊 | ガリレオ・ガリレイ | 1937/1948 | 絶版 |
| 動物の心臓ならびに血液の運動に関する解剖学的研究 | ハーヴェイ | 1961 | |
| 血液循環の原理 | ハーヴェイ | 1936 | 絶版 「動物の…」に改題 |
| 科学論文集 | パスカル | 1953 | 絶版 |
| 光学 | ニュートン | 1940 改版1983 | 絶版 |
| 動物哲学 | ラマルク | 1954 | 絶版 |
| 電気学実験研究 全２冊 | ファラデー | 1941/1945 | 絶版 |
| 力と物質 | ファラデー | 1949 | 絶版 |
| ロウソクの科学 | ファラデー | 1933 改訳1956 | |
| 化学通信 全４冊 | リービッヒ | 1952 | ３，４巻未刊 |
| 栽培植物の起源 全３冊 | ドゥ・カンドル | 1953/1958 | 絶版 |
| ビーグル号航海記 全３冊 | ダーウィン | 1959/1961 | |
| 種の起源 全２冊 | ダーウィン | 1929 改訂1939 改訳1963 改訳1990 | |
| 育成動植物の趨異 全２冊 | ダーウィン | 1937 | 絶版 |
| 人及び動物の表情について | ダーウィン | 1931 | 絶版 |
| チャールズ・ダーウイン | エフ・ダーウイン | 1927 | 絶版 |
| 実験医学序説 | ベルナール | 1938 改訳1970 | |
| 自然認識の限界について/宇宙の七つの謎 | レーモン | 1928 | 絶版 |
| アルプスの氷河 全２冊 | チンダル | 1932 | 絶版 |
| アルプスの旅より | チンダル | 1933 | 絶版 |
| アルプス紀行 | チンダル | 1934 改版1940 | 絶版 |
| 力の恒存について | ヘルムホルツ | 1949 | 絶版 |
| 自然発生説の検討 | パストゥール | 1970 | |
| 雑種植物の研究 | メンデル | 1928 | 絶版 |
| 天才と遺伝 全２冊 | ゴールトン | 1935 | 絶版 |
| ファーブル昆虫記 全１０冊 | ファーブル | 1930 改版1958 改版1993 | |
| 科学談義 | ハックスリ | 1940 | 絶版 |
| ダーウィニズム論集 | 八杉竜一編訳 | 1994 | 絶版 |
| 数について | デーデキント | 1961 | |
| 自然美と其驚異 | ラバック | 1933 | 絶版 |
| 生命の不可思議 全２冊 | ヘッケル | 1928 | 絶版 |
| 近代医学の建設者 | メチニコフ | 1968 | 絶版 |
| 植物の育成 全８冊 | バーバンク | 1955 | 絶版 |
| 大脳半球の働きについて 全２冊 | パブロフ | 1975 | 絶版 |
| 数学教育論 | ムーア | 1936 | 絶版 |
| 化学の学校 全３冊 | オストワルド | 1940 改版1952 改訳1977 | 絶版 |
| エネルギー | オストワルド | 1938 | 絶版 |
| 科学と仮説 | ポアンカレ | 1938 改訳1959 | |
| 科学の価値 | ポアンカレ | 1927 改版1937 改訳1977 | 絶版 |
| 科学と方法 | ポアンカレ | 1927 改訳1953 | 絶版 |
| 科学者と詩人 | ポアンカレ | 1928 | 絶版 |
| 晩年の思想 | ポアンカレ | 1939 | 絶版 |
| 史的に見たる科学的宇宙観の変遷 | アーレニウス | 1931 改版1944 | 絶版 |
| 原子 | ペラン | 1978 | 絶版 |
| 近世数学史談 | 高木貞治 | 1995 | |
| 気候と文明 | ハンチントン | 1938 | 絶版 |
| 相対性理論 | アインシュタイン | 1988 | |
| 大陸と海洋の起源 全２冊 | ヴェーゲナー | 1981 | 絶版 |
| 家畜系統史 | ケルレル | 1935 | 絶版 |
| 微生物の狩人 全２冊 | クライフ | 1980 | 絶版 |
| 物質と光 | ドゥ・ブロイ | 1972 | |
| 確率の哲学的試論 | ラプラス | 1997 |